91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2793 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 284 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  89.08 
 
 		 284 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  62.67 
 
 		 295 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  64.39 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  71.75 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  61.71 
 
 		 275 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  61.71 
 
 		 275 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  61.71 
 
 		 275 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  61.71 
 
 		 275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  70.75 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  71.15 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  71.15 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  71.15 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  71.15 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  71.15 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  71.15 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  70.67 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  45.75 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  44.64 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  48.06 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.33 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.33 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  44.49 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.64 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  46.01 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  39.89 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.89 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 237 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  35.06 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  31.9 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  36.05 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  31.18 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  29.74 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 409 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 607 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 607 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 139 aa  49.7  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 607 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 607 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  34.25 
 
 		 607 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 607 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 607 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 613 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 191 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.49 
 
 		 730 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 409 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  27.93 
 
 		 780 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 780 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 2262 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  29.05 
 
 		 613 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 613 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1092 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.81 
 
 		 733 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 		 1056 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 1091 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 563 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  32.52 
 
 		 606 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4942  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00284868  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.15 
 
 		 818 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.9 
 
 		 810 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1278  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 429 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2013  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1402 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.23 
 
 		 1022 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.56 
 
 		 695 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  31.86 
 
 		 821 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  35.05 
 
 		 1124 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  31.86 
 
 		 776 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  31.86 
 
 		 776 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 780 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 		 1737 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  31.86 
 
 		 776 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  35.85 
 
 		 606 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 878 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 606 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  35.85 
 
 		 606 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 606 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  35.85 
 
 		 606 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  35.85 
 
 		 606 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  35.85 
 
 		 606 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.48 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 		 2240 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1421 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 		 781 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  29.03 
 
 		 797 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>