71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2699 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  40.1 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  34.78 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  32.45 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.41 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  39.55 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  32.32 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.94 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  28.7 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  32.26 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  28.95 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.92 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.92 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  32.49 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  27.96 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  29.5 
 
 		 229 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  28.21 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  32.02 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.6 
 
 		 599 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  33.59 
 
 		 603 aa  52.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 553 aa  52.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1121 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 566 aa  49.3  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 209 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 884 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 3145 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.44 
 
 		 689 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 789 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 562 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  28.8 
 
 		 577 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 		 352 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  31.03 
 
 		 1098 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 574 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 883 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 542 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 634 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  29.89 
 
 		 160 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 149 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 566 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1314  peptidase M, neutral zinc metallopeptidase, zinc-binding site  29.27 
 
 		 909 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.917609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.27 
 
 		 577 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2326  hypothetical protein  32.43 
 
 		 245 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.343306  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 700 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 629 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  34.78 
 
 		 708 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0479  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>