50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1408 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 295 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  67.8 
 
 		 280 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  68.46 
 
 		 280 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  63.73 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  63.73 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  63.39 
 
 		 275 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  63.05 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  77.36 
 
 		 295 aa  309  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  77.88 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  64.79 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  77.88 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  77.88 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  77.88 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  77.88 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  77.88 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  77.88 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  65.92 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.06 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.06 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  42.99 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  43.09 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  45.86 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  40.09 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.99 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.1 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  40.1 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  42.33 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 237 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  31.08 
 
 		 253 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  34.16 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  30.09 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  31.36 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  30.81 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  29.67 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  30.16 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 269 aa  45.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 2262 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  26.8 
 
 		 821 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  26.8 
 
 		 776 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  26.8 
 
 		 776 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  26.8 
 
 		 776 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 607 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 607 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  36.04 
 
 		 607 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  29.79 
 
 		 937 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1499  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.62 
 
 		 494 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  26.14 
 
 		 821 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>