57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2537 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  564  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  96.15 
 
 
311 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  96.63 
 
 
311 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  96.63 
 
 
311 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  96.63 
 
 
311 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  96.63 
 
 
311 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  96.63 
 
 
311 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  96.63 
 
 
311 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  66.21 
 
 
295 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  63.61 
 
 
275 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  63.61 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  63.61 
 
 
275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  62.9 
 
 
280 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  62.03 
 
 
275 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  63.18 
 
 
280 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  61.17 
 
 
284 aa  291  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  62.27 
 
 
284 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  44.3 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  45 
 
 
305 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.74 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.74 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  40.53 
 
 
273 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  45.73 
 
 
343 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.95 
 
 
306 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.56 
 
 
279 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  36.56 
 
 
279 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  35.29 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  33.5 
 
 
245 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  31.52 
 
 
253 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  32.58 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  30.94 
 
 
342 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  31.79 
 
 
229 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  30.12 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
566 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
161 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  29.75 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
607 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.42 
 
 
573 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
607 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
607 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  32.54 
 
 
607 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1521  hypothetical protein  34.92 
 
 
120 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689528  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 
1737 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
409 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.22 
 
 
2240 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  31.2 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  31.2 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  31.2 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  31.2 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  31.2 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  31.2 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
606 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>