47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1948 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  99.68 
 
 		 311 aa  590  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  99.68 
 
 		 311 aa  590  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  99.68 
 
 		 311 aa  590  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  590  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  99.68 
 
 		 311 aa  590  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  99.68 
 
 		 311 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  99.04 
 
 		 311 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  84.38 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  65.45 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  61.09 
 
 		 275 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  61.09 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  61.09 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  60.84 
 
 		 275 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  61.17 
 
 		 280 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  60.77 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.28 
 
 		 284 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  60.64 
 
 		 284 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  45.42 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  44.07 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.15 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.15 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  44.2 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  39.41 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  45.73 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.67 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  36.56 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.56 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  35.29 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  33.33 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  32.72 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  35.66 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  31.49 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  31.95 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  29.52 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 566 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 1737 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 607 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1521  hypothetical protein  34.92 
 
 		 120 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689528  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  29.11 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 607 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  34.92 
 
 		 607 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1421 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>