More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1753 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 366 aa  725    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 718 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.65 
 
 		 875 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 878 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.18 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.25 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 		 689 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.92 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 909 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 927 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4689  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.62 
 
 		 837 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 685 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.81 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.82 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.84 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1676 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.22 
 
 		 764 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 1085 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1276 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.27 
 
 		 816 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1138 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.11 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 744 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.86 
 
 		 725 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 645 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 614 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 2240 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.86 
 
 		 622 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.41 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 637 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 614 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 614 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.41 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.41 
 
 		 614 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.41 
 
 		 614 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 968 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.29 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 1069 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.22 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.29 
 
 		 818 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 615 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 739 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 4489 aa  59.7  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 1406 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 620 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.67 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.62 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 3145 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  26.53 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.9 
 
 		 577 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 828 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 886 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1421 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.9 
 
 		 577 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1450 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 465 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 879 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 611 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 265 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  27.07 
 
 		 797 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 3172 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.5 
 
 		 1764 aa  57  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 		 508 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 612 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 2262 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 639 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 708 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 3035 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 754 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 465 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 732 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 		 1022 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.58 
 
 		 865 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  30.49 
 
 		 503 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26 
 
 		 582 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  29.46 
 
 		 632 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>