More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0741 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
191 aa  388  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  58.76 
 
 
199 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  60 
 
 
201 aa  214  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  54.86 
 
 
201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  48.59 
 
 
194 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.03 
 
 
199 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  45.51 
 
 
198 aa  160  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
207 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
583 aa  68.2  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
615 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
1737 aa  65.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
878 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  32.2 
 
 
430 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
762 aa  64.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
685 aa  64.3  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.53 
 
 
810 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
361 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 
917 aa  64.3  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
244 aa  62.8  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 
366 aa  62.4  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
828 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  29.27 
 
 
514 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
637 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
828 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.74 
 
 
784 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.03 
 
 
397 aa  61.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.41 
 
 
620 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
3145 aa  61.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.71 
 
 
267 aa  61.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.54 
 
 
237 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 
621 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 
1276 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
681 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  33.58 
 
 
1676 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
376 aa  60.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.27 
 
 
603 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 
3172 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  37.08 
 
 
560 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 
352 aa  59.3  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
399 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 
452 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  38.38 
 
 
725 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  32.48 
 
 
936 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
620 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  32.12 
 
 
865 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  40.96 
 
 
486 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 
212 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  34.21 
 
 
1979 aa  58.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
828 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 
249 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 
927 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.31 
 
 
758 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
356 aa  57.4  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.31 
 
 
1034 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 
249 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.27 
 
 
622 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
740 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.72 
 
 
875 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  30.11 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
4079 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
1049 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
543 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
280 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
279 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.4 
 
 
725 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  31.73 
 
 
1067 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
574 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.58 
 
 
1694 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  37 
 
 
1061 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
362 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
1129 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  39.53 
 
 
272 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
602 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2921  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.56 
 
 
550 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  32.47 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.67 
 
 
818 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  31.43 
 
 
713 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 
357 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  34.09 
 
 
636 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
162 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3181  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 
254 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385251  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
909 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.32 
 
 
816 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.47 
 
 
266 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 
652 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  31.37 
 
 
577 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 
632 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.37 
 
 
1056 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1005 aa  54.3  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
1486 aa  54.3  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07687  mitochondrial outer membrane translocase receptor (TOM70), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01660)  27.87 
 
 
636 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.146912 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.17 
 
 
764 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  34.09 
 
 
718 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>