More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0105 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0105  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 230 aa  466  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 718 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.57 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.01 
 
 		 725 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3145 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 374 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.23 
 
 		 875 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 878 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.97 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.45 
 
 		 810 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.37 
 
 		 622 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.71 
 
 		 733 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.82 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  38.74 
 
 		 865 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 632 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 754 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1969  tetratricopeptide TPR_2  35.9 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.467519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 685 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 754 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 789 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3640  Tetratricopeptide domain protein  31.06 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.560507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.63 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.82 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  29.57 
 
 		 594 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.49 
 
 		 708 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 909 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.97 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  26.75 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.01 
 
 		 764 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 		 3301 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  29.47 
 
 		 695 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 612 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 697 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 1061 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  25.21 
 
 		 594 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.19 
 
 		 795 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 		 512 aa  55.5  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  25.14 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  27.67 
 
 		 444 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 605 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 645 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 689 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 750 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  39.39 
 
 		 430 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  36.17 
 
 		 400 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 1737 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.83 
 
 		 1154 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 647 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 1034 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1676 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 649 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1005 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.6 
 
 		 416 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 649 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  23.93 
 
 		 514 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1421 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  28.26 
 
 		 585 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.48 
 
 		 1022 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 3172 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  29.47 
 
 		 936 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 1450 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.4 
 
 		 837 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 400 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 847 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.31 
 
 		 603 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30.28 
 
 		 887 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 139 aa  51.6  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.12 
 
 		 577 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  25.46 
 
 		 599 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  28.85 
 
 		 703 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 595 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 632 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 620 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 573 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.63 
 
 		 714 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1481  MCP methyltransferase, CheR-type  32.94 
 
 		 513 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 646 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 715 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.61 
 
 		 561 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.97 
 
 		 816 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>