58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3640 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3640  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.560507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.19 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0105  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
230 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.38 
 
 
725 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
3172 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
3145 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
637 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
673 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.87 
 
 
1764 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1121  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 
660 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
808 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  28.45 
 
 
681 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1542  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
358 aa  49.3  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000957604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
1406 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.7 
 
 
622 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
3301 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.7 
 
 
764 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  20.98 
 
 
482 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
448 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25 
 
 
2145 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
221 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
909 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
847 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.53 
 
 
594 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 
597 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.81 
 
 
810 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3372  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
4095 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
878 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
677 aa  46.6  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 
2240 aa  45.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.25 
 
 
733 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.63 
 
 
571 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
466 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.74 
 
 
887 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  34.94 
 
 
1676 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  32.29 
 
 
837 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.52 
 
 
816 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  28.92 
 
 
937 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0059  tetratricopeptide repeat domain protein  23.56 
 
 
656 aa  43.9  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
466 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
685 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
750 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.54 
 
 
582 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
754 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
448 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 
754 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 
1040 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  22.41 
 
 
695 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.35 
 
 
624 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  27.85 
 
 
2059 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.59 
 
 
865 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  23.7 
 
 
569 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
873 aa  42.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
762 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>