64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1121 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1121  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 660 aa  1368    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.75 
 
 		 1979 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.95 
 
 		 864 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 563 aa  55.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 		 734 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.22 
 
 		 795 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  26.16 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.1 
 
 		 810 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 860 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 878 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 927 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 464 aa  50.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3640  Tetratricopeptide domain protein  30.51 
 
 		 267 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.560507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 217 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.28 
 
 		 676 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 2262 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 2262 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 265 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 789 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 		 1022 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.48 
 
 		 725 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  27.03 
 
 		 535 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 562 aa  47.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  26.28 
 
 		 703 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2046  tetratricopeptide protein  26.76 
 
 		 315 aa  47.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000249019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.85 
 
 		 739 aa  47.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  25.52 
 
 		 417 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  28.15 
 
 		 433 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.06 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 4079 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1256  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.37 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.54 
 
 		 875 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  27.41 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 573 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  23.46 
 
 		 551 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.26 
 
 		 818 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 762 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  27.72 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 884 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 599 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 208 aa  45.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 363 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1404 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.06 
 
 		 561 aa  45.8  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.17 
 
 		 733 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 		 589 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 3172 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 		 426 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 616 aa  44.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2188  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.56 
 
 		 801 aa  44.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  30.08 
 
 		 1186 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 265 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 582 aa  44.3  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 3301 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 		 486 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  27.87 
 
 		 832 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.49 
 
 		 1056 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 273 aa  43.9  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.66 
 
 		 739 aa  43.9  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 597 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  25.14 
 
 		 514 aa  43.9  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 808 aa  43.9  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>