More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3704 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  96.5 
 
 		 428 aa  724    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  89.4 
 
 		 433 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 426 aa  820    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  65.31 
 
 		 495 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4512  protein of unknown function DUF124  33.33 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.89 
 
 		 810 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 878 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.79 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 		 808 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.09 
 
 		 863 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 718 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 3145 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 247 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 585 aa  57  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 605 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.05 
 
 		 619 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  32.59 
 
 		 218 aa  57  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.49 
 
 		 1764 aa  57  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.4 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  41.86 
 
 		 667 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.85 
 
 		 733 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  29.52 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  26.15 
 
 		 231 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  35.79 
 
 		 592 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 		 818 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  32.26 
 
 		 676 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.9 
 
 		 1034 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 248 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 828 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 		 633 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 762 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.89 
 
 		 576 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 544 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 631 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 620 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.33 
 
 		 206 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 409 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 		 633 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  27.52 
 
 		 299 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 572 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.25 
 
 		 2240 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1180 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.92 
 
 		 577 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.92 
 
 		 577 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 1005 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  33.94 
 
 		 593 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.78 
 
 		 620 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.02 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 592 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.89 
 
 		 739 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1948  tetratricopeptide domain-containing protein  44.59 
 
 		 198 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.746225  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 934 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 615 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 622 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 643 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  28.19 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 927 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.52 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  37.72 
 
 		 656 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.68 
 
 		 594 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 486 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.66 
 
 		 622 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 689 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 988 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.62 
 
 		 742 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 357 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  29.49 
 
 		 221 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0663  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 255 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 250 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 289 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 352 aa  50.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 471 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 614 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 		 626 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 		 626 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.75 
 
 		 875 aa  50.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 870 aa  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 614 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.66 
 
 		 764 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 649 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>