31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1948 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1948  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.746225  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.97 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1473  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00324934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2363  hypothetical protein  43.48 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.56 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2503  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.84 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0241049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 534 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.21 
 
 		 426 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  45.21 
 
 		 433 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  45.21 
 
 		 428 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1801  Tetratricopeptide repeat protein  32.38 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  31.73 
 
 		 603 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3287  Tetratricopeptide domain protein  24.16 
 
 		 348 aa  45.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 553 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 		 924 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.98 
 
 		 407 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 403 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 264 aa  42  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  27.42 
 
 		 832 aa  42  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 634 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0541  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0685  tetratricopeptide TPR_4  35.8 
 
 		 438 aa  41.2  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.80167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2528  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 535 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  30.39 
 
 		 538 aa  41.2  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>