200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4512 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4512  protein of unknown function DUF124  100 
 
 
533 aa  1072    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  34.27 
 
 
428 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.71 
 
 
426 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  32.37 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 
495 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
1276 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
1297 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.97 
 
 
267 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 
870 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
927 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  30.43 
 
 
992 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
522 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.66 
 
 
1979 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
361 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.7 
 
 
398 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.75 
 
 
292 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
306 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.85 
 
 
462 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
3145 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
543 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30 
 
 
581 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
4079 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
1421 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
315 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  29.41 
 
 
233 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 
249 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
446 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
329 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 
249 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
717 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 
279 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 
245 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30.63 
 
 
436 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  22.27 
 
 
231 aa  51.6  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.24 
 
 
738 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
585 aa  50.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.36 
 
 
810 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
357 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.85 
 
 
471 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
404 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
360 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
717 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
363 aa  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  25.21 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
878 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 
343 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 
373 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
718 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.19 
 
 
850 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
1106 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
632 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.4 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.03 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  25.77 
 
 
636 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 
784 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24.32 
 
 
635 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
1049 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
273 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
629 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.43 
 
 
539 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 
632 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  24.43 
 
 
638 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.08 
 
 
436 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
313 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.78 
 
 
626 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 
818 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 
252 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
572 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 
1106 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
265 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 
1694 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
465 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.65 
 
 
626 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 
758 aa  48.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  26.56 
 
 
519 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
169 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
371 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0844  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
310 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.89 
 
 
743 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 
296 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.65 
 
 
614 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1499  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
494 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.11 
 
 
706 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.65 
 
 
614 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
614 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  31.87 
 
 
584 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 
295 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.65 
 
 
626 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.78 
 
 
820 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
202 aa  47.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
750 aa  47.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0815  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
310 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
614 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
614 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.78 
 
 
458 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
543 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
201 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>