More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4410 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 360 aa  723    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  85.67 
 
 		 357 aa  596  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 		 543 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  38.35 
 
 		 927 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 162 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1276 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 4079 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  39.26 
 
 		 623 aa  87  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 699 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 602 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.27 
 
 		 1979 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 618 aa  82.8  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.34 
 
 		 560 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  35.29 
 
 		 1007 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 740 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 562 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  40.18 
 
 		 1069 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.43 
 
 		 573 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.09 
 
 		 1694 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 4489 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 3560 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.8 
 
 		 576 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  30.65 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 3035 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 		 636 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 711 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 		 466 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.85 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 836 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  37.04 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 		 955 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 740 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 1094 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  34.82 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 761 aa  69.7  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 169 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1138 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.03 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  27.67 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.52 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.98 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1192 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.3 
 
 		 745 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 935 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.88 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.52 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  31.35 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.71 
 
 		 730 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.06 
 
 		 810 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  31.91 
 
 		 743 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 732 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 1121 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 574 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  29.56 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 878 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  29.2 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  27.22 
 
 		 191 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  29.29 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 1827 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  29.1 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.17 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  31.79 
 
 		 1013 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  32.14 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.89 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2559  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.41 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>