More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1499 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1499  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
494 aa  970    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.05 
 
 
479 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000170755  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0632  tetratricopeptide TPR_2  36.22 
 
 
541 aa  187  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
878 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
1069 aa  97.1  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.45 
 
 
810 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
505 aa  90.1  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.39 
 
 
1694 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
4079 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.74 
 
 
635 aa  76.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
927 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 
1297 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 
1737 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
566 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 
2240 aa  70.1  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
562 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
761 aa  69.7  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
543 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
1276 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.75 
 
 
620 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.68 
 
 
586 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
448 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.16 
 
 
264 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
620 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
767 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 
467 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
315 aa  63.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.2 
 
 
1013 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
909 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.42 
 
 
1676 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
1094 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 
634 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 
395 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
311 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
750 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
512 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.09 
 
 
1138 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.53 
 
 
1979 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
280 aa  60.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
615 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.45 
 
 
689 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
2262 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 
486 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.85 
 
 
917 aa  60.1  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
883 aa  60.1  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.59 
 
 
936 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
265 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.89 
 
 
576 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.78 
 
 
363 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.78 
 
 
363 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 
614 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 
626 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 
626 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.31 
 
 
818 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
614 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 
614 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
614 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 
433 aa  58.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.75 
 
 
292 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 
626 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  22.57 
 
 
643 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 
1049 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  26.42 
 
 
955 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
503 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
323 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 
602 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.34 
 
 
730 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
639 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
468 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
366 aa  57  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
265 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  27.86 
 
 
452 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.67 
 
 
550 aa  56.6  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
748 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2322  tetratricopeptide repeat protein  25.62 
 
 
1400 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 
356 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
635 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
685 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
611 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
614 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
713 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.61 
 
 
668 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.48 
 
 
816 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
505 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.86 
 
 
632 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
635 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.13 
 
 
715 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
607 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  24.54 
 
 
653 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 
552 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
288 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
627 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
612 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.75 
 
 
784 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
847 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>