More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1106 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 371 aa  743    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  57.19 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2366  TPR repeat-containing protein  49.66 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.062914  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 629 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 878 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 649 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.65 
 
 		 810 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 3145 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  29.27 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 		 1056 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 		 818 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.54 
 
 		 1022 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 988 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.25 
 
 		 784 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 718 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27 
 
 		 632 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  30.05 
 
 		 344 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.78 
 
 		 626 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.78 
 
 		 626 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1276 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.7 
 
 		 875 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.81 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  28.93 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.81 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.11 
 
 		 820 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 927 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.78 
 
 		 1056 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 		 847 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1421 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 824 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 602 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 615 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.75 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 637 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 611 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.85 
 
 		 733 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 639 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.1 
 
 		 1979 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002652  Flp pilus assembly protein TadD  24.62 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 3560 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3963  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.187703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 612 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  26.62 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 636 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  25.21 
 
 		 643 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  26.62 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 686 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.2 
 
 		 620 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 637 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 620 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 614 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 594 aa  72.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  27.03 
 
 		 582 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 685 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 648 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 257 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 1737 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.97 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.68 
 
 		 706 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  30.51 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.89 
 
 		 1694 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.51 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.14 
 
 		 884 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 3172 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 3035 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  24.05 
 
 		 706 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 1827 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 762 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.07 
 
 		 795 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 2262 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 833 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.43 
 
 		 1013 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 713 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>