More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0663 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0663  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 927 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 543 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 1276 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.81 
 
 		 784 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.28 
 
 		 1022 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 1056 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.81 
 
 		 818 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.57 
 
 		 560 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 878 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1056 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.62 
 
 		 988 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 591 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4079 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.21 
 
 		 810 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1276 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 		 564 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.98 
 
 		 706 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1138 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.23 
 
 		 1979 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.35 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.72 
 
 		 836 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.84 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 649 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.5 
 
 		 1694 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.81 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.41 
 
 		 745 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  27.01 
 
 		 582 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 713 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.86 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.39 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.97 
 
 		 573 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.18 
 
 		 715 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.81 
 
 		 539 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 306 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 662 aa  65.1  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 3035 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.74 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 4489 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.75 
 
 		 730 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1049 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 3560 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  28.48 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 1421 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.07 
 
 		 706 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1192 aa  62.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 750 aa  62.4  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.84 
 
 		 1013 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1827 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 		 632 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.13 
 
 		 576 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.02 
 
 		 391 aa  62  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  27.74 
 
 		 283 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.78 
 
 		 778 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.68 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2141  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.33 
 
 		 839 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  28.83 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  25.47 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 406 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 406 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>