More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4608 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1404 aa  2877    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.72 
 
 		 1737 aa  112  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1676 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.62 
 
 		 2240 aa  107  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.71 
 
 		 1022 aa  105  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.34 
 
 		 927 aa  102  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.65 
 
 		 810 aa  96.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.84 
 
 		 643 aa  95.1  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 878 aa  93.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 1069 aa  92.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 617 aa  90.9  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 		 988 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.28 
 
 		 576 aa  88.6  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.82 
 
 		 1056 aa  88.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 1276 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.85 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.09 
 
 		 795 aa  81.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 637 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.41 
 
 		 1056 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  22.78 
 
 		 837 aa  80.1  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.52 
 
 		 818 aa  79.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 602 aa  78.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 883 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.8 
 
 		 626 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 392 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.6 
 
 		 1694 aa  75.1  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.41 
 
 		 883 aa  74.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.44 
 
 		 626 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 718 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 614 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.44 
 
 		 614 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.44 
 
 		 614 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.44 
 
 		 626 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 632 aa  74.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.69 
 
 		 462 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 615 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  21.29 
 
 		 764 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 614 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  21.14 
 
 		 955 aa  73.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 636 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 614 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.84 
 
 		 1067 aa  73.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  20.09 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 1252 aa  72.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.86 
 
 		 557 aa  72  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 409 aa  71.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 605 aa  71.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 639 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 376 aa  71.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  23.65 
 
 		 681 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 512 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.93 
 
 		 784 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 1297 aa  70.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  21.88 
 
 		 936 aa  70.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.12 
 
 		 732 aa  70.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 612 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  19.88 
 
 		 4079 aa  70.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 202 aa  69.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.39 
 
 		 742 aa  69.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 847 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  24.66 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 1252 aa  68.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.64 
 
 		 3301 aa  69.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  26.02 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24 
 
 		 622 aa  68.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 4489 aa  68.6  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  21.02 
 
 		 409 aa  68.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.65 
 
 		 547 aa  67.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 515 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.14 
 
 		 465 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.94 
 
 		 706 aa  68.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  21.33 
 
 		 417 aa  67.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 		 648 aa  67.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  21.62 
 
 		 573 aa  67.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 748 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 884 aa  67  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1094 aa  67  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 249 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 611 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 635 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 249 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 635 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.71 
 
 		 725 aa  66.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 		 1421 aa  66.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.69 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.31 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 968 aa  66.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.53 
 
 		 707 aa  65.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.69 
 
 		 887 aa  65.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  20.52 
 
 		 827 aa  65.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 591 aa  64.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>