103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3194 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  37.42 
 
 		 1157 aa  742    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  37.42 
 
 		 1157 aa  739    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  88.28 
 
 		 1172 aa  2054    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  38 
 
 		 1160 aa  735    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  87.86 
 
 		 1172 aa  2045    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  37.72 
 
 		 1140 aa  740    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  41.77 
 
 		 1157 aa  834    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  100 
 
 		 1186 aa  2364    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  37.5 
 
 		 1157 aa  743    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  37.42 
 
 		 1157 aa  739    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  39.62 
 
 		 1180 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  39.29 
 
 		 1150 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  39.62 
 
 		 1172 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  39.38 
 
 		 1150 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  39.29 
 
 		 1180 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  37.42 
 
 		 1157 aa  742    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  37.42 
 
 		 1157 aa  742    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  40.61 
 
 		 1164 aa  793    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  40.34 
 
 		 1159 aa  793    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  42.53 
 
 		 289 aa  239  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  29.84 
 
 		 1265 aa  191  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  25.18 
 
 		 1267 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  29.54 
 
 		 1259 aa  180  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  31.36 
 
 		 1271 aa  172  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  29.92 
 
 		 1542 aa  171  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  31.19 
 
 		 1588 aa  167  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  29.34 
 
 		 1230 aa  166  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  29.02 
 
 		 1569 aa  166  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  29.09 
 
 		 1297 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  28.81 
 
 		 1297 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  28.81 
 
 		 1297 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  29.41 
 
 		 1244 aa  155  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  28.94 
 
 		 1315 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  32.23 
 
 		 1471 aa  149  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  29.31 
 
 		 1324 aa  148  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  30.94 
 
 		 1315 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  29.46 
 
 		 1548 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  30.08 
 
 		 1574 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  30.59 
 
 		 1580 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  30.59 
 
 		 1574 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  28.96 
 
 		 1313 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1544 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  30.33 
 
 		 1266 aa  139  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  31.8 
 
 		 1331 aa  131  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  29.07 
 
 		 1367 aa  126  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  30.51 
 
 		 1309 aa  102  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 878 aa  61.6  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  26.05 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 643 aa  57  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.52 
 
 		 632 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.26 
 
 		 887 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.65 
 
 		 676 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1197 aa  53.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1069 aa  52.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.47 
 
 		 358 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1161 aa  52  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 566 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  33.94 
 
 		 784 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 3035 aa  50.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 740 aa  49.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 3145 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  19.71 
 
 		 3172 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 808 aa  49.3  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 556 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  31.76 
 
 		 1077 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.66 
 
 		 810 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 713 aa  48.5  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  28.08 
 
 		 283 aa  48.5  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.55 
 
 		 1000 aa  48.5  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2118  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 504 aa  48.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.83 
 
 		 620 aa  47.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 512 aa  47.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 305 aa  48.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.88 
 
 		 884 aa  47.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.37 
 
 		 401 aa  48.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.459695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 		 1213 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.73 
 
 		 1486 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  25.09 
 
 		 637 aa  47.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3461  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 154 aa  47.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  23.63 
 
 		 573 aa  46.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2281  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  26.4 
 
 		 507 aa  46.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  19.05 
 
 		 448 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 2651 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 573 aa  46.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 450 aa  46.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 4079 aa  45.8  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.37 
 
 		 790 aa  46.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 796 aa  45.8  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  25.22 
 
 		 929 aa  45.8  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  35.37 
 
 		 790 aa  45.8  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 566 aa  45.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 597 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 686 aa  45.8  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1676 aa  45.8  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 573 aa  45.8  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  52.08 
 
 		 639 aa  45.8  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  31.41 
 
 		 773 aa  45.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6145  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 477 aa  45.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  24.3 
 
 		 321 aa  45.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  36.36 
 
 		 499 aa  45.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>