More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3430 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  55.81 
 
 
683 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  100 
 
 
695 aa  1373    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  48.2 
 
 
707 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  43.43 
 
 
668 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  43.68 
 
 
672 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  42.01 
 
 
612 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0731  hypothetical protein  40.85 
 
 
567 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2266  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
622 aa  170  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.63 
 
 
462 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
878 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
361 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
685 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.84 
 
 
810 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.63 
 
 
706 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
681 aa  101  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  34.21 
 
 
340 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.11 
 
 
1676 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
955 aa  99  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
637 aa  97.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
362 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31 
 
 
1022 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.49 
 
 
875 aa  95.9  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.16 
 
 
816 aa  94.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.66 
 
 
314 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.86 
 
 
725 aa  94  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.95 
 
 
706 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
649 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.5 
 
 
1694 aa  91.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
284 aa  90.9  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.65 
 
 
334 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 
935 aa  90.1  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
543 aa  89.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
617 aa  89.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
4079 aa  89  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 
406 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 
406 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
828 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
828 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.96 
 
 
539 aa  88.2  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
909 aa  87.8  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.64 
 
 
733 aa  87.8  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
465 aa  87.8  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 
1056 aa  87.8  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
739 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.73 
 
 
1138 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
927 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.87 
 
 
632 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  34.9 
 
 
594 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
3172 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 
371 aa  87  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.77 
 
 
837 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
4489 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
515 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
3145 aa  85.5  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.94 
 
 
865 aa  85.1  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  37.87 
 
 
789 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
602 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.28 
 
 
818 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
1276 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.59 
 
 
582 aa  84.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.55 
 
 
622 aa  84  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  28.11 
 
 
581 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
1421 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 
750 aa  82.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  27.03 
 
 
936 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.35 
 
 
764 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
547 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
828 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.72 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 
639 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
573 aa  82  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
732 aa  81.6  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.98 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
762 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 
612 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  32.46 
 
 
725 aa  81.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 
576 aa  81.3  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 
636 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
605 aa  80.9  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
3035 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  28.87 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
750 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
280 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 
3560 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
1192 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
391 aa  79.7  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  27.23 
 
 
306 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 
556 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 
847 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
740 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.21 
 
 
745 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.93 
 
 
626 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
601 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.19 
 
 
1056 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.12 
 
 
1056 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>