More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0504 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
169 aa  345  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  43.18 
 
 
543 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  39.02 
 
 
745 aa  90.9  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  39.17 
 
 
191 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
927 aa  87.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  38.64 
 
 
1694 aa  85.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  35 
 
 
1138 aa  85.1  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.66 
 
 
560 aa  85.1  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
329 aa  84.3  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 
602 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.59 
 
 
632 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  34.97 
 
 
576 aa  82.8  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
1276 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  38.17 
 
 
573 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.58 
 
 
397 aa  80.9  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.81 
 
 
836 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 
1069 aa  80.9  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  33.09 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.33 
 
 
623 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  28.87 
 
 
715 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
244 aa  79  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
366 aa  77.4  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  37.69 
 
 
562 aa  76.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 
1979 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  45.12 
 
 
398 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
591 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
713 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
3145 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 
784 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  34.45 
 
 
1007 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
393 aa  72  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
465 aa  71.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
878 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
388 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
280 aa  71.2  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
388 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
3035 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
452 aa  70.9  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 
810 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  33.58 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
1049 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
4079 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
750 aa  68.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
388 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
596 aa  68.6  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
1192 aa  68.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  35.04 
 
 
550 aa  68.2  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 
3560 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
1297 aa  67.8  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
512 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.41 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.25 
 
 
887 aa  67.4  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
715 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
202 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  34.4 
 
 
648 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  30.65 
 
 
635 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
602 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  33.85 
 
 
1056 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 
574 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
608 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
361 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
804 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  34.4 
 
 
1013 aa  65.1  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
828 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
393 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
349 aa  64.7  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
662 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
395 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
740 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
523 aa  64.7  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
332 aa  64.7  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
357 aa  64.3  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
685 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.13 
 
 
707 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
1276 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
732 aa  64.3  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 
465 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
425 aa  64.3  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
217 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
739 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 
758 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  40.7 
 
 
688 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>