More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0433 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.58 
 
 
248 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  51.64 
 
 
248 aa  258  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  53.15 
 
 
299 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  50.6 
 
 
247 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.2 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  49.8 
 
 
250 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
243 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  29.08 
 
 
538 aa  95.9  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.52 
 
 
820 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2655  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2559  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.26 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
566 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
1737 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 
689 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
1421 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
714 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
3145 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2464  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545805  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.5 
 
 
1676 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.94 
 
 
733 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
878 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
649 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
374 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
766 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.88 
 
 
764 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.32 
 
 
661 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
4079 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 
1694 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1276 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.15 
 
 
810 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.88 
 
 
622 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  24.11 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
715 aa  69.3  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
589 aa  68.9  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.56 
 
 
725 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
362 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.98 
 
 
746 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  25.73 
 
 
725 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
758 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.75 
 
 
626 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.88 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
614 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
614 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.23 
 
 
887 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.7 
 
 
566 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25 
 
 
730 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
847 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.88 
 
 
832 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
1034 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
562 aa  65.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
614 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 
626 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
311 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.88 
 
 
340 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 
614 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  26.7 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3557  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.738103  normal  0.175293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
718 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 
614 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.79 
 
 
1056 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.27 
 
 
406 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
909 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.25 
 
 
1979 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
3035 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.27 
 
 
406 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
645 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.32 
 
 
626 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
612 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 
714 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
611 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
602 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
685 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
635 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.63 
 
 
2240 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
636 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
635 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 
576 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
389 aa  62.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1022 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
1005 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
486 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
686 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1550  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.12 
 
 
297 aa  62.4  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>