185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3557 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3557  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
283 aa  585  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.738103  normal  0.175293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  29.03 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
3145 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
594 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
792 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
716 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
1180 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
3035 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
685 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 
542 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
1178 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25.47 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  33.33 
 
 
706 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.77 
 
 
632 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
942 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
392 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.23 
 
 
916 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
209 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.59 
 
 
746 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  36.25 
 
 
462 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.97 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  30.58 
 
 
334 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
750 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
169 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
518 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
3560 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
878 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
681 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
605 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
547 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.93 
 
 
820 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  36.21 
 
 
1694 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  31.25 
 
 
538 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
750 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 
818 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3768  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.36 
 
 
725 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.24 
 
 
739 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0275  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
587 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
732 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 
357 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.84 
 
 
839 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
523 aa  49.3  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.23 
 
 
988 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.26 
 
 
810 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  24.66 
 
 
1004 aa  48.9  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.56 
 
 
626 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.05 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
687 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  21.08 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
499 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.05 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
4079 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
699 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.12 
 
 
1007 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
371 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
565 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
3301 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
1192 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.51 
 
 
639 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.45 
 
 
1022 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
626 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
637 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
1276 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
909 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
626 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
123 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
376 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  47.5 
 
 
743 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 
265 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
614 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.15 
 
 
706 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
123 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
614 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
614 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
614 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.11 
 
 
1764 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  25.41 
 
 
750 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.94 
 
 
784 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.93 
 
 
707 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
649 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
562 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
614 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
522 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
522 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
927 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.67 
 
 
397 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.77 
 
 
1154 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
361 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>