More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1550 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1550  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 297 aa  586  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389536  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.98 
 
 		 733 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2367  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  26.92 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000700104  normal  0.549255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  27.68 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  25.76 
 
 		 538 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1226  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.13 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0380935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  31.06 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2654  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.47 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3150  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.41 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0633925  hitchhiker  0.00734203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3007  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.41 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000355185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2992  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.41 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00509234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4603  Type IV pilus biogenesis protein PilF  30.99 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.05 
 
 		 810 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3314  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  25.29 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1422  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.52 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1430  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.38 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.14258  normal  0.202712 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1284  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  29.3 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1303  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.2 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0082  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.69 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1288  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.03 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1432  hypothetical protein  26.13 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  25.98 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1297  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.58 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.276388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.22 
 
 		 632 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0733  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.88 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0881  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.36 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904873  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1542  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.86 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1057  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.27 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0988004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1371  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.64 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.503899  normal  0.0591536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1870  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.82 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 3145 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58946e-23 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0851  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.36 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.92 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 718 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1227  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  23.46 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2987  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 194 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1603  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0684116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1931  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0417979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1301  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1114  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.54 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2559  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1658  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1149  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.26 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588418  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2088  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.883758  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2655  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2852  tetratricopeptide TPR_2  24.24 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40310  type IV pilus biogenesis protein PilF  30.12 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2464  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1432  type IV pilus biogenesis protein PilF  25.82 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1904  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.38 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  27.84 
 
 		 661 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33.11 
 
 		 820 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1213  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  23.94 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  31.15 
 
 		 936 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.23 
 
 		 1154 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 1034 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.58 
 
 		 2240 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  23.61 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 3035 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.18 
 
 		 1007 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 363 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 602 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.24 
 
 		 837 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1005 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  29.6 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 1486 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 		 1056 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 649 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 685 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1779  type IV pilus assembly protein PilF  25.25 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.81 
 
 		 764 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3611  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.32 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1309  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  27.01 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  26.44 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1246  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.619631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5021  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  23.92 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.667321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.47 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.64 
 
 		 725 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2309  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1125  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.41 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.377413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>