More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4642 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 249 aa  519  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  47.86 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  48.03 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  47.86 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  47.86 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.7 
 
 		 810 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 878 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.92 
 
 		 1056 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 632 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 649 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 784 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1022 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.85 
 
 		 818 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 875 aa  89  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.22 
 
 		 1056 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.02 
 
 		 988 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 847 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 685 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.7 
 
 		 622 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.18 
 
 		 614 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.18 
 
 		 614 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 614 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.18 
 
 		 626 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 614 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.3 
 
 		 626 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.83 
 
 		 626 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 3145 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 611 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.04 
 
 		 820 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 		 566 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 4489 aa  79.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 635 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 635 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.23 
 
 		 764 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 750 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.65 
 
 		 397 aa  79  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 615 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 639 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1094 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 636 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 637 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.94 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 448 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.19 
 
 		 795 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 		 1040 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 612 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 620 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 614 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.41 
 
 		 837 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1085 aa  75.1  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 689 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.27 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.27 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 827 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.23 
 
 		 725 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 681 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 3035 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 909 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.1 
 
 		 594 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 573 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 465 aa  72.4  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 879 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 637 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1406 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 		 1737 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 597 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1676 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 750 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.48 
 
 		 782 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.42 
 
 		 733 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.13 
 
 		 1694 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.12 
 
 		 1979 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 1827 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1276 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 594 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  25.35 
 
 		 648 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 715 aa  68.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 602 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 750 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 512 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.57 
 
 		 603 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  26.15 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 3560 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  25.62 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>