More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3510 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  99.57 
 
 
234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  99.57 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  84.78 
 
 
250 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  47.86 
 
 
249 aa  241  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
878 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.74 
 
 
810 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 
543 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.22 
 
 
632 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
649 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
739 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
1022 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
3145 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
909 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.43 
 
 
725 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
362 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.2 
 
 
816 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
750 aa  86.3  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
718 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
681 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.98 
 
 
875 aa  85.1  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
685 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.7 
 
 
1056 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.54 
 
 
1056 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.36 
 
 
622 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.14 
 
 
988 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 
784 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
1094 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
612 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
637 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.54 
 
 
603 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.21 
 
 
764 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
1005 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.79 
 
 
733 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
594 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 
1034 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 
818 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.58 
 
 
820 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.29 
 
 
865 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
4079 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28 
 
 
566 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 
689 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
639 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
617 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
573 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.23 
 
 
1694 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
750 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.71 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 
626 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
3301 aa  75.5  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
3172 aa  75.5  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
1406 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
3560 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.18 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
750 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
636 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.88 
 
 
545 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
3035 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
847 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
715 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 
1276 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.36 
 
 
979 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
612 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.93 
 
 
706 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
448 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
673 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.22 
 
 
1154 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.59 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.15 
 
 
626 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.15 
 
 
614 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.15 
 
 
614 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
614 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 
1486 aa  71.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 
586 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.36 
 
 
837 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.89 
 
 
620 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
602 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
611 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  23.56 
 
 
750 aa  70.5  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
635 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
635 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
615 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.49 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  44 
 
 
766 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.92 
 
 
1676 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
927 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
762 aa  68.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>