290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1284 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1284  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
375 aa  741    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1550  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
297 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
927 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
1276 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.62 
 
 
707 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.57 
 
 
725 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 
750 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
716 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
301 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 
743 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
295 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
1192 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 
286 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.14 
 
 
730 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
4079 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  27.18 
 
 
1240 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 
2240 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
388 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
3560 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.59 
 
 
887 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.58 
 
 
462 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  27.05 
 
 
295 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
636 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
323 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
213 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
306 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  34.04 
 
 
252 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  28.46 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 
1694 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
162 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
593 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.35 
 
 
286 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.26 
 
 
1007 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
4489 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
718 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.02 
 
 
733 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  28.85 
 
 
475 aa  53.5  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
1827 aa  53.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 
295 aa  53.5  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
634 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 
564 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
1421 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
215 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
515 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
286 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
301 aa  52.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  35.25 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
594 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0900  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
172 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00123871  normal  0.293983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
565 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
1127 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 
308 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.8 
 
 
622 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
1276 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
1094 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
697 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.58 
 
 
581 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
3145 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 
784 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  25.36 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
209 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 
810 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
543 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
593 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3682  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
288 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338983  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
1049 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
878 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 
212 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
329 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
319 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
254 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
559 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.65 
 
 
807 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.84 
 
 
689 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
247 aa  50.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  23.65 
 
 
620 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.16 
 
 
314 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.26 
 
 
1979 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
221 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
605 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.62 
 
 
635 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.53 
 
 
1067 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
291 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1777  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
710 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2252  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
954 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.39 
 
 
764 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.5 
 
 
1001 aa  49.7  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
404 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>