93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0551 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  49.7 
 
 		 1006 aa  964    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  46.4 
 
 		 1004 aa  883    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1001 aa  2028    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  30.55 
 
 		 1005 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1023 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1019 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1024 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1012 aa  284  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1031 aa  278  3e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  21.1 
 
 		 995 aa  188  6e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.03 
 
 		 1000 aa  170  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  24.54 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  34.09 
 
 		 239 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.56 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  34.04 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  34.04 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  34.04 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 		 938 aa  57.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1180 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  32.98 
 
 		 272 aa  56.6  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  31.91 
 
 		 269 aa  57  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0006  hypothetical protein  21.88 
 
 		 283 aa  56.2  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000521994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  32.98 
 
 		 266 aa  55.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 257 aa  55.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0967  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 		 890 aa  55.1  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 264 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 543 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  26.45 
 
 		 254 aa  53.5  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 689 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  31.91 
 
 		 258 aa  52  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 750 aa  52  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  31.91 
 
 		 258 aa  51.6  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  28.95 
 
 		 272 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  28.95 
 
 		 272 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 393 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.62 
 
 		 322 aa  50.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1284  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.5 
 
 		 375 aa  50.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 572 aa  50.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  29.29 
 
 		 264 aa  50.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  25 
 
 		 236 aa  50.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  27.62 
 
 		 322 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 804 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 271 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 292 aa  49.7  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  28.28 
 
 		 263 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 263 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 263 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 263 aa  48.9  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 263 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 263 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 226 aa  49.3  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 263 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  28.28 
 
 		 263 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 263 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  21.4 
 
 		 715 aa  48.5  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 468 aa  48.5  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 273 aa  48.1  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 589 aa  48.1  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 		 214 aa  48.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 262 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 325 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  27.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2360  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 346 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0361524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 262 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 262 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 262 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  28.28 
 
 		 262 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.45 
 
 		 340 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 356 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  29.89 
 
 		 321 aa  46.6  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 502 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  26.88 
 
 		 278 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 878 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.02 
 
 		 1295 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 269 aa  46.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.68 
 
 		 573 aa  46.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3602  TPR repeat-containing protein  20.22 
 
 		 345 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.310162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  33.78 
 
 		 487 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.19 
 
 		 790 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 4079 aa  45.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 250 aa  45.8  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.45 
 
 		 281 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.45 
 
 		 281 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 		 1459 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  45.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.35 
 
 		 1979 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 315 aa  45.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 758 aa  45.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  20.45 
 
 		 404 aa  45.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.37 
 
 		 271 aa  44.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 762 aa  44.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 572 aa  44.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  44.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>