196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0826 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 271 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  52.22 
 
 		 275 aa  254  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  46.95 
 
 		 278 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  47.48 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  47.67 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  44.76 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  43.71 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  36.02 
 
 		 266 aa  139  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  31.65 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  27.65 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  42.86 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  30.86 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  24.84 
 
 		 318 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  39.52 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 287 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  37.7 
 
 		 335 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  27.14 
 
 		 293 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  25.1 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 236 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  38.84 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  28.02 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  25.18 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  27.04 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  37.6 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  28.63 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  36.21 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  26.05 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  33.9 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.9 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  32.87 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  36.28 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  31.34 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  31.3 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  25.27 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  24.03 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  33.93 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  24.28 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  34.29 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  24.45 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  31.58 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  27.43 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  26.35 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  32.17 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  32.17 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  27.69 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  25.25 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  23.87 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  29.84 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  24.27 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  24.27 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  25.11 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  29.7 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  29.37 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  29.37 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  29.37 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  29.37 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  29.37 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  29.37 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  29.37 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  29.37 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  25.11 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  29.91 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  34.09 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  25.11 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  31.9 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  25.57 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  25.11 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  31.58 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  32.61 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  29.13 
 
 		 321 aa  62  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.91 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  34.78 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  23.41 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  26.85 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  32.61 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  34.78 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  34.78 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>