213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3117 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  70.4 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  55.6 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  55.43 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  33.82 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  29.8 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  34.09 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  30.66 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  36.24 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  29.81 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  31.38 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  31.09 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  30.04 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  31.36 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  30.91 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  30.91 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  30.91 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  36.49 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  30.86 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  29.43 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  29.43 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  36.95 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  29.77 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  36.19 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  29.58 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  28.41 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  30.26 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  30.7 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  30.87 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  36.1 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  36.1 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  29.63 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  30 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  29.89 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  30.04 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  29.39 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  29.39 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  29.39 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  33.65 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  28.95 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  28.64 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  37.01 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  31 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  28.05 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  29.17 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  32.14 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  30.36 
 
 		 301 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  34.64 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  37.3 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  37.3 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  37.3 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  28.45 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  29.05 
 
 		 305 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  29.05 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.59 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  25.73 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  26.76 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  28.18 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  31.73 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  31.73 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  39.32 
 
 		 487 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  31.73 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  31.73 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  30.11 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  28.64 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  31.36 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  28.96 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  29.81 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  34.52 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  29.81 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  29.33 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  36 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  37.72 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  37.1 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>