196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0617 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  49.64 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  47.51 
 
 		 256 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  49.6 
 
 		 255 aa  234  9e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  45.39 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  36.96 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  36.94 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  26.3 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  25.8 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  24.05 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  34.21 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  25.18 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  26.61 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  34.82 
 
 		 325 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  27.16 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  31.11 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  31.11 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  31.11 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  31.11 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  31.11 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  31.11 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.11 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  32.03 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  25 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  25.93 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  24.68 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  25.49 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  28.93 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  22.57 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  31.32 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  31.32 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  31.32 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  31.32 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  29.21 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 377 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  25.54 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  24.23 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  23.27 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  24.24 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  28.28 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  27.32 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  28.89 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  23.74 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  23.14 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  20.73 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  31.34 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  25 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  29.06 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  26.5 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  26.5 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0694  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0490074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  23.08 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  25.66 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  27.01 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  29.52 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  29.52 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1745  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00037341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  27.48 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  29.52 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0924  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  31.36 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.708476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  24.1 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  22.14 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  24.1 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  24.1 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  24.1 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  24.1 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  24.1 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  21.17 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  26.72 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  23.47 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  26.72 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  28.57 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  29.13 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  24.1 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  29.13 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  29.13 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  29.13 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  23.71 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>