227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2552 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  47.46 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  48.18 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  33.51 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  40.16 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  31.78 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  30.4 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  28.21 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  40.35 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  32.98 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  40.34 
 
 		 272 aa  91.7  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  30.33 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  39.47 
 
 		 268 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  39.52 
 
 		 272 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  39.47 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  39.47 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  24.27 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  39.47 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  40.35 
 
 		 273 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  40.35 
 
 		 279 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  24.88 
 
 		 322 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  27.3 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  32.46 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  30.69 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  34.78 
 
 		 321 aa  85.5  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  37.07 
 
 		 304 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 377 aa  85.1  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  36.59 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  25.35 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  30.21 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  27.69 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  30.04 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  30.04 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  30.53 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  36.97 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  26.79 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  37.39 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  29.15 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  30.66 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  29.91 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  32.14 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  29.6 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  34.95 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  45.26 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  26.69 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  26.42 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  34 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  26.73 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  26.73 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  26.73 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  29.15 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  26.73 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  36.52 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  35.59 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  27.64 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  26.88 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  36.52 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  32.04 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  28.7 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  28.7 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  29.09 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  34.34 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  26.34 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  34.34 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  34.34 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  34.34 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  34.34 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  29.82 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  34.34 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  29.82 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  26.34 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  26.34 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  26.34 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  26.34 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  26.34 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>