259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1158 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  83.46 
 
 		 272 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  77.41 
 
 		 269 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  77.41 
 
 		 269 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  77.41 
 
 		 269 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  79.85 
 
 		 258 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  79.1 
 
 		 258 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  71 
 
 		 263 aa  348  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  71 
 
 		 263 aa  348  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  71 
 
 		 263 aa  348  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  71 
 
 		 263 aa  348  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  71 
 
 		 263 aa  348  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  71 
 
 		 263 aa  348  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  75.37 
 
 		 266 aa  347  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  70.63 
 
 		 263 aa  346  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  70.63 
 
 		 263 aa  346  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  70.63 
 
 		 263 aa  346  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  70.63 
 
 		 262 aa  324  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  70.63 
 
 		 262 aa  324  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  70.63 
 
 		 262 aa  324  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  70.63 
 
 		 262 aa  324  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  70.63 
 
 		 264 aa  321  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  71 
 
 		 262 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  40.08 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  35.85 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  37.21 
 
 		 241 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  35.42 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  33.61 
 
 		 251 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  36.55 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  39.08 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  32.66 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  34.87 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  34.87 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  36.55 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  34.87 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  35.98 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  34.32 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  35.15 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  35.15 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  34.3 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  29.43 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  33.65 
 
 		 188 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  34.84 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  35.06 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  32.83 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02682  Tetratricopeptide TPR_2  34.44 
 
 		 176 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000113893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  29.66 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  31.11 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  33.78 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  29.04 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  33.66 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  31.12 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  31.12 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  31.12 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  29.55 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  35.35 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  30.58 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0101  hypothetical protein  29.1 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.354435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  33.17 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  30.3 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  28.35 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  28.35 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  37.19 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  37.19 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  27.3 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  29.63 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  27.46 
 
 		 236 aa  85.5  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  30.53 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  30.56 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  30.56 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  30.56 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  29.11 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  30.56 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  30.56 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  30.56 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  30.73 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  31.21 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  30.67 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  27.05 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  33.08 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  38.02 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  35.48 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  38.02 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  27.78 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  32.14 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>