194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2729 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  79.34 
 
 		 242 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  71.07 
 
 		 240 aa  350  8.999999999999999e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  70.66 
 
 		 241 aa  339  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  67.74 
 
 		 250 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  69.23 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  69.23 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  69.23 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  68.83 
 
 		 249 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  68.42 
 
 		 249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  59.62 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  67.34 
 
 		 250 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  68.15 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  68.15 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  63.93 
 
 		 245 aa  297  8e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  59.77 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  41.33 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  40.51 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  41.44 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  43.32 
 
 		 188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  41.41 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  40.34 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  37.6 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  37.6 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  37.6 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  39.66 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  37.7 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  35.91 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  35.91 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  35.91 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  35.91 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  35.91 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  35.9 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  35.9 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  35.91 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  35.91 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  36.05 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  35.91 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  35.47 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  35.34 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  35.47 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  34.7 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  36.32 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  36.17 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  35.85 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  34.9 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  30.34 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  29.8 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  31.66 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02682  Tetratricopeptide TPR_2  37.28 
 
 		 176 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000113893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  31.84 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  29.51 
 
 		 305 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  29.51 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  39.83 
 
 		 271 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  30.32 
 
 		 322 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  31.02 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  38.17 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  37.4 
 
 		 268 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  37.4 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  38.93 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  30 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  36.89 
 
 		 279 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.23 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  25.62 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  27.09 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  26.7 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  31.17 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  26.14 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  25.76 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  35.9 
 
 		 487 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2527  hypothetical protein  26.56 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000191168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  34.09 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  26.73 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  27.23 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  27.23 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  27.23 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  25.25 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  26 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  30.37 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  26 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  26 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  26 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  34.55 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  29.17 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  27.78 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>