227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2227 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  530  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  41.6 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  33.81 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  41.4 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  31.76 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  37.89 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  36.09 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  33.19 
 
 		 271 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  30.9 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  35.09 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  29.89 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  37.56 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  34.63 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  33.19 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  37.95 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  32.71 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  37.95 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  35.71 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  32.22 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  35.71 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  31.7 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  35.71 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  31.58 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  35.27 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  32.03 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  34.82 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  34.82 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  31.75 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  28.57 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  32.82 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  31.75 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  31.75 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  43.17 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  31.28 
 
 		 249 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  31.28 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  31.35 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  31.28 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  31.28 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  31.28 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  31.28 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  31.28 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  31.28 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  30.81 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  31.28 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  30.81 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  34.74 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  30.81 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  32.82 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  30.81 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  32 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  30.81 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  30.33 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  30.04 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  30.4 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  32.14 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  32.5 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  35.32 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  31.65 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  33.47 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  34.18 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  29.61 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  29.61 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  31.25 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  35.94 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.07 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.07 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  31.31 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  29.67 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  31.52 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  31.31 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  28.38 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.04 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  28.38 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  32.54 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  30.19 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>