254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3692 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 
239 aa  488  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  47.46 
 
 
242 aa  235  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  42.66 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  40 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  43.33 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  29.83 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  30.88 
 
 
249 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  27.75 
 
 
285 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
257 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  39.67 
 
 
304 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  29.31 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  29.96 
 
 
278 aa  95.5  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
264 aa  95.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  28.37 
 
 
263 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
294 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 
377 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  31.46 
 
 
272 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
271 aa  91.7  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  34.43 
 
 
350 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  34.19 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  38.02 
 
 
343 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  42.72 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  29.26 
 
 
188 aa  89  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  43.14 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  23.94 
 
 
275 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  39.32 
 
 
272 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  39.32 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  29.95 
 
 
254 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  38.46 
 
 
279 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  35.25 
 
 
322 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  37.61 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  37.61 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  27.13 
 
 
276 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  36.75 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.78 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  38.58 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  36.75 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  36.84 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  28.24 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  44.9 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  35 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  37.8 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  40 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  31.18 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  39.2 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  35.04 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  36.84 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  40.2 
 
 
262 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  37.6 
 
 
271 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  40.2 
 
 
262 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  40.2 
 
 
262 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  40.2 
 
 
262 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  39.22 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  39.22 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  39.22 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  39.22 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  39.22 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  41.41 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  39.22 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  39.22 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  26.73 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  39.22 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  39.22 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  40.2 
 
 
266 aa  81.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  33.8 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  35.59 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  39.05 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  37.72 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  40.35 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  26.24 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  26.24 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  26.24 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  36.45 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  35.9 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  35.09 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  26.24 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  26.24 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  27.98 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  26.24 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  26.54 
 
 
284 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  32.82 
 
 
261 aa  79  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  31.82 
 
 
335 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  26.98 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>