195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2337 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  100 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  37.25 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  34.22 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  38.28 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  38.28 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  30.37 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 		 253 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  34.85 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  32.23 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  33.85 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  31.44 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  31.06 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  30.15 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  30.31 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  29.64 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  29.32 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  29.32 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  29.32 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  29.32 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  29.32 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  29.32 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  29.39 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  29.06 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  32.79 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  29.04 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  30.92 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  28.68 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  29.39 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  28.46 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  28.46 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  28.46 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  28.05 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  30.81 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  31.12 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  27.19 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  27.39 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  26.97 
 
 		 271 aa  89  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  26.34 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  29.12 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  29.35 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  26.75 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  24.89 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  25 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  24.23 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  23.81 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  25.98 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  25.98 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  28.43 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  29.58 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  25.44 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.98 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  27.06 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  26.52 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  25.09 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  23.14 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  24.48 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  26.03 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  25.74 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  24.27 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  25.96 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3336  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3417  hypothetical protein  25.51 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  24.41 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  24.23 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  26.07 
 
 		 305 aa  62  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  26.07 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  26.47 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3481  hypothetical protein  24.48 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  24.77 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  26.22 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  25.5 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  26.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  26.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  26.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  26.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  26.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  26.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  26.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  26.13 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>