197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01613 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  383  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  87.57 
 
 		 250 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  69.23 
 
 		 254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  57.3 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  48.37 
 
 		 240 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  45.45 
 
 		 242 aa  160  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  44.56 
 
 		 250 aa  157  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  45.26 
 
 		 245 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  45.31 
 
 		 249 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  45.31 
 
 		 249 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  45.31 
 
 		 249 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  44.79 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  43.75 
 
 		 249 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  42.78 
 
 		 243 aa  150  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  44.62 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  38.38 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  45.6 
 
 		 250 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  45.6 
 
 		 250 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  42.5 
 
 		 254 aa  148  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  39.34 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  43.09 
 
 		 241 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  38.14 
 
 		 251 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  39.89 
 
 		 255 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  36.98 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  38.22 
 
 		 262 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  38.22 
 
 		 262 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  38.22 
 
 		 262 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  38.22 
 
 		 262 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  36.98 
 
 		 263 aa  121  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  36.98 
 
 		 263 aa  121  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  36.98 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  36.46 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  36.98 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  36.98 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  36.98 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  36.98 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  36.98 
 
 		 263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  36.65 
 
 		 262 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  37.77 
 
 		 258 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  37.57 
 
 		 258 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  34.17 
 
 		 269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  35.03 
 
 		 266 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  31.94 
 
 		 262 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  33.17 
 
 		 269 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  33.17 
 
 		 269 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  33.17 
 
 		 269 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  33.66 
 
 		 272 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  31.82 
 
 		 258 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 270 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 274 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  32.88 
 
 		 322 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  31.98 
 
 		 322 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  34.2 
 
 		 254 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  34.31 
 
 		 274 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  31.02 
 
 		 243 aa  91.3  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  30.93 
 
 		 273 aa  90.5  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  30.14 
 
 		 265 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.26 
 
 		 239 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 257 aa  89  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 248 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  31.96 
 
 		 272 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  30.65 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  27.59 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  30.65 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  30.65 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  27.73 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  30.65 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  29.69 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02682  Tetratricopeptide TPR_2  38.84 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000113893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  30.11 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  29.95 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2527  hypothetical protein  28.74 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000191168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  29.73 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  39.32 
 
 		 268 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  39.32 
 
 		 268 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  38.46 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  38.46 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  29.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  27.43 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  39.32 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  27.98 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  29.03 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  29.03 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  29.03 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  28.49 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  33.04 
 
 		 487 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  26.46 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  26.64 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  29.79 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  28.27 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  29.53 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  29.15 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>