203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0465 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 377 aa  770    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  43.33 
 
 		 265 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  36.02 
 
 		 285 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 257 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  39.5 
 
 		 239 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  34.53 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  37.96 
 
 		 283 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  37.8 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  37.04 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  34.25 
 
 		 278 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  37.93 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  34.62 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  37.93 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  37.07 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  36.07 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  33.58 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  34.19 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  34.65 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  32.08 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  32.08 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  34.96 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  35.25 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  33.87 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  33.61 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  35.04 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  37.01 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  35.46 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  32.48 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  32.23 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  34.17 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  30.58 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  32.54 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  31.67 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  33.91 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  29.71 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  35.25 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  33.33 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  34.34 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  28 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  34.19 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  33.6 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  32.48 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  36.56 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  33.04 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  32.48 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  31.58 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  29.82 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  34.45 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  34.19 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 253 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  29.84 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 263 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  34.13 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  29.84 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  30.43 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  35.14 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  30.58 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  35.4 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  37.5 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  35.34 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  34.45 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  32.17 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  34.51 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  31.4 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  31.01 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  34.51 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  34.51 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  34.51 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  34.23 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  29.23 
 
 		 232 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  36.28 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  33.94 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  30.7 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  32.04 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  31.86 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  29.25 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  32.11 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>