198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0568 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 276 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  40.53 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  40.47 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  36.97 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  37.63 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  28.85 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  28.85 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  29.65 
 
 		 322 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  28.32 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  30.84 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  29.27 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.51 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  27.71 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  31.03 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  35.8 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  28.43 
 
 		 239 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  29.55 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  27.84 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  29.49 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  28.37 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  27.21 
 
 		 304 aa  95.5  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  27.84 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  28.4 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  28.25 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  30.16 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  26.24 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  30.48 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  25.45 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  25.45 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  31.12 
 
 		 188 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  26.13 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  29.89 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  27.15 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  27.31 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  28.12 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  27.88 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  27.4 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  30.77 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  29.35 
 
 		 234 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  29.35 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  29.35 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  29.35 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  29.35 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  29.35 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  30.05 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  27.63 
 
 		 254 aa  89  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 269 aa  89  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  25.67 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  25.54 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  25.67 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  28.64 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  25.12 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  29.58 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  25.12 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  29.58 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  27.68 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  27.68 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  27.68 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  27.57 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  27.23 
 
 		 249 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  28.04 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.81 
 
 		 236 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  25.12 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  37.19 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  26.05 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  24.17 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  29.09 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  28.64 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  27.91 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  29.25 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  29.15 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  28.98 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  28.28 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  31.82 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  29.11 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  29.11 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  26.87 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  26.87 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  26.87 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  27.88 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>