224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1986 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 253 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  79.45 
 
 		 253 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  64.26 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  64.26 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  64.81 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  60.32 
 
 		 260 aa  304  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  61.41 
 
 		 249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  62.93 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  62.93 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  56.41 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  43.32 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  41.7 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  43.62 
 
 		 274 aa  198  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  44.88 
 
 		 283 aa  198  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  43.15 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  42.8 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  43.1 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  42.8 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  42.26 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  37.94 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  41.81 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  41.3 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  41.3 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  41.3 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  41.3 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  41.3 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  41.3 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  41.3 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  39.74 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  39.69 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  39.91 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  39.74 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  39.91 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  39.91 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  39.22 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  35.27 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  34.25 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  34.9 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  33.72 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  37.8 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  27.73 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  28.51 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  26.82 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  29.87 
 
 		 232 aa  95.5  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  27.6 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  28.05 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  28.7 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  30.21 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  27.31 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  27.49 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  25.11 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  32 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  27.31 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  24.89 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  34.21 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  28.04 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  31.75 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  26.21 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  34.45 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.61 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  28.41 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  32 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 487 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  29.37 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  29.37 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  28.69 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  26.26 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  23.08 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  23.98 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  30.43 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  30.43 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  25.23 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  29.13 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  24.62 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  33.62 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  31.2 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  33.04 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  37.25 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  25.89 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  24.29 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  33.93 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  24.39 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>