200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0729 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 255 aa  519  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  36.98 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 240 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  39.09 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  39.09 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  41.1 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  39.73 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  39.73 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  39.27 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 242 aa  151  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  40.57 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  39.73 
 
 		 254 aa  148  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  35.51 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  37.31 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  37.22 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  39.09 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  39.09 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  35.34 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  36.53 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  40.87 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  36.94 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  39.89 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  34.25 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  34.25 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  30.38 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  30.38 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  32.19 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 263 aa  118  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  30.4 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  29.09 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  29.09 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  30.4 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  29.09 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  30.4 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  30.97 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  30.97 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  31.42 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  31.42 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  44.07 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  29.52 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  40.3 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  33.96 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  31.22 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  32.83 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  29.82 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  32.84 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  28.51 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  40.46 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  40.46 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  41.98 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  40.46 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  30.52 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  41.94 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  41.22 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  39.69 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  31.08 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  26.87 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  37.61 
 
 		 487 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.28 
 
 		 322 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  28.92 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  27.64 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  27.64 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  28.26 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  28.26 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  28.26 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  28.26 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  28.26 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  27.23 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02682  Tetratricopeptide TPR_2  30.11 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000113893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  37.3 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  30.17 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  26.64 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  28.51 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  36.29 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  25.36 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  37.27 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  33.73 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  25.63 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  25 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  25.36 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  26.94 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  33.06 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  31.88 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  25.25 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  26.02 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  26.02 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>