200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0500 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 343 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 		 377 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  38.66 
 
 		 275 aa  92.8  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 275 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  37.61 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  36.64 
 
 		 285 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  38.02 
 
 		 239 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  37.61 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  35.82 
 
 		 278 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  37.61 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  38.05 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  29.07 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  40.38 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  34.45 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  38.46 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  36.89 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  36.89 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  29.32 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  36.3 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  39.8 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  38.46 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  37.27 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  32.03 
 
 		 245 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 255 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  31.5 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  28.38 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  31.93 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  30.52 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  36.13 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  44.83 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  35.45 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  34.78 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  45.26 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  45.98 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  36.75 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  34.21 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  31.58 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  42.7 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  31.58 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  31.33 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  29.32 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  35.21 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  40.2 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  41.57 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 257 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  37.25 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  31.5 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  31.65 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  35.04 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  36.59 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  33.09 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  41.38 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  34.23 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  40.45 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  37.04 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  32.48 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  31.78 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  42.53 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  32.71 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  30.07 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  31.62 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  29.32 
 
 		 505 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  32.71 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  38.71 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  31.62 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  29.58 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  29.58 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  29.58 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  29.58 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  31.48 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  34.55 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  29.58 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  29.52 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  29.58 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  32.48 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  29.58 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  29.58 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  32.73 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  34.23 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  34.23 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  40 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  30.63 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  40 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  34.23 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>