235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2208 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  30.25 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  32.94 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  32.88 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  31.39 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.93 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 275 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.81 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  30.32 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  31.71 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  28.42 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  31.18 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  26.46 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  29.33 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  38.66 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.73 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  26.41 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  31.28 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  39.6 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  27.39 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  28.63 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  35.4 
 
 		 222 aa  85.5  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  26.56 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  29.11 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  32.79 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  25.43 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  35 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  32.48 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  33.05 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  26.59 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  35.42 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  28.77 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  24.78 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  23.89 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  23.89 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  31.67 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  31.01 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  33.03 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  25.78 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  35.29 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  34.55 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  22.6 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  25.91 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  24.51 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  29.23 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  29.23 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  29.82 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  28.97 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  29.06 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  26.67 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.91 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  24.02 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  28.46 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  29.35 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  24.02 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  24.02 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  24.02 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  24.02 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  24.02 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  21.74 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  30.48 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  21.74 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  21.86 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  21.74 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  32.11 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  21.74 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  29.63 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  24.77 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  21.89 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  29.63 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  23.65 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  23.44 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  23.44 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  26.23 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  32.38 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  32.38 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  28.04 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>