190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1114 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 292 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  35.54 
 
 		 335 aa  168  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  36.98 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  42.74 
 
 		 333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  27.74 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  28.47 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  27.89 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  24.56 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  27.78 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  25.74 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  30.73 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  34.71 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  27.83 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  35.71 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  36.84 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  28.36 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  27.11 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  24.29 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.19 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  31.9 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  34.48 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  30.77 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  35.94 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  35 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  24.28 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  25.55 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  36.11 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  24.67 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  34.96 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  32.71 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  34.96 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  35.87 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  32.71 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  23.9 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  27.89 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  30.56 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  21.38 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  24.79 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  31.3 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  24.59 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  30.25 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  31 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  29.11 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  29.11 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  29.5 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  24.46 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  37.5 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.866947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  31.97 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  35.23 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  25.65 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  26.58 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  35.23 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  25.54 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  26.96 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  23.84 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  27.48 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  23.05 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  31.46 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  32.94 
 
 		 395 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  23.74 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  27.93 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  29 
 
 		 241 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  23.74 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  23.74 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  27.73 
 
 		 285 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  22.63 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  22.63 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  34.09 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  25.21 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  30.34 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.29 
 
 		 746 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  25.21 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  29.63 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  32.63 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  28.04 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  28.04 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  25.21 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  25.21 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>