176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3038 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  47.48 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  45.11 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  43.82 
 
 		 275 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  44.98 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  41.76 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  41.67 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  28.07 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  30.92 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  32.5 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  25.63 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  31.46 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  40.34 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  26.49 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  24.56 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  39.52 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  27.12 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  36.59 
 
 		 335 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  27.68 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  27.12 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.78 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  24.19 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  25 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  23.9 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  27.31 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  28.5 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  27.19 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  23.97 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  27.31 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  27.1 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  25.2 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  26.46 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  27.88 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  35.65 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  29.32 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  31.09 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  38.39 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  36.51 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  24.65 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  25.12 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  36.11 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  34.17 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  32.58 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  30.15 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  34.55 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  34.82 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  29.66 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  33.08 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  23.72 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  25.65 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  25.65 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  25.65 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  25.65 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  25.65 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  25.65 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  28.19 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  29.66 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  23.47 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  31.82 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  23 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  26.67 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  25.23 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  31.45 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  23.47 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  23.47 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  23.47 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  23.47 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  26.98 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  27.09 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  35.16 
 
 		 487 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  30.65 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  24.58 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  29.29 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  25.84 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3402  Tol-Pal system YbgF  30.19 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.517203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>