73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1651 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 995 aa  2007    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1004 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  21.66 
 
 		 1006 aa  213  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1023 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 1012 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.1 
 
 		 1001 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 1024 aa  167  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 1019 aa  166  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  21.76 
 
 		 1005 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1031 aa  144  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.99 
 
 		 1000 aa  100  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 257 aa  57  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2596  hypothetical protein  24.65 
 
 		 320 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 4079 aa  53.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 591 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 264 aa  51.6  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  29.91 
 
 		 272 aa  51.2  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  32.11 
 
 		 250 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  32.11 
 
 		 250 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  32.11 
 
 		 250 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  32.41 
 
 		 268 aa  51.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  32.11 
 
 		 249 aa  50.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  30.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  30.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.05 
 
 		 782 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 952 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  29.47 
 
 		 258 aa  49.3  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  29.67 
 
 		 264 aa  49.3  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  31.19 
 
 		 250 aa  49.3  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 465 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  29.47 
 
 		 258 aa  49.3  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 262 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 262 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 262 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 262 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  30.77 
 
 		 262 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.66 
 
 		 462 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  28.3 
 
 		 278 aa  48.5  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  31.19 
 
 		 249 aa  48.5  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  31.19 
 
 		 249 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  31.19 
 
 		 249 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 249 aa  48.5  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  27.44 
 
 		 721 aa  48.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  27.37 
 
 		 269 aa  48.1  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  22.75 
 
 		 288 aa  47.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  24.88 
 
 		 538 aa  47.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.77 
 
 		 304 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  28.17 
 
 		 643 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 269 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 1385 aa  47  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.1 
 
 		 322 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 269 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 269 aa  46.6  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.07 
 
 		 639 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  27.52 
 
 		 236 aa  45.8  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 481 aa  45.8  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0544  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 1077 aa  45.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000321228  normal  0.11155 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.41 
 
 		 1979 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  28.04 
 
 		 241 aa  45.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  29.33 
 
 		 222 aa  44.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  26.4 
 
 		 1101 aa  44.3  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0235  TPR repeat-containing protein  20.72 
 
 		 554 aa  44.7  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 272 aa  44.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 793 aa  44.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>