56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1538 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1012 aa  2051    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 1024 aa  585  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 1019 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1031 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1023 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  27.86 
 
 		 1005 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1004 aa  317  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  25.1 
 
 		 1006 aa  317  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.38 
 
 		 1001 aa  288  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  22.84 
 
 		 995 aa  196  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  22.73 
 
 		 1000 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 4079 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 		 707 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.14 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.48 
 
 		 1694 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 486 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 631 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 1077 aa  53.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 602 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2232  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 946 aa  52.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 884 aa  51.6  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  23.9 
 
 		 519 aa  51.2  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.3 
 
 		 573 aa  50.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 750 aa  51.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  22.79 
 
 		 2401 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 534 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 605 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 		 938 aa  50.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.46 
 
 		 740 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 287 aa  49.3  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 393 aa  48.5  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 502 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  48.5  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 634 aa  48.1  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 409 aa  48.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0967  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.06 
 
 		 890 aa  47.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215323  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 1276 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  27.88 
 
 		 229 aa  47.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 804 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  23.91 
 
 		 261 aa  46.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  22.77 
 
 		 1213 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 261 aa  46.2  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 466 aa  45.8  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 392 aa  45.8  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1297 aa  45.8  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 409 aa  45.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 233 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 833 aa  45.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 264 aa  45.8  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 217 aa  45.4  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  31.08 
 
 		 267 aa  45.4  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 243 aa  45.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 761 aa  44.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 376 aa  44.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4345  hypothetical protein  22.29 
 
 		 291 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 344 aa  44.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>