68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2327 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1023 aa  2082    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  31.38 
 
 		 1005 aa  493  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  28.44 
 
 		 1006 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1004 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1024 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1031 aa  365  2e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 		 1001 aa  361  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1012 aa  356  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1019 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  22.7 
 
 		 995 aa  201  7e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.62 
 
 		 1000 aa  140  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  26.36 
 
 		 322 aa  57  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  29.81 
 
 		 322 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  25 
 
 		 255 aa  56.2  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  26.25 
 
 		 918 aa  55.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  31.97 
 
 		 232 aa  55.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3602  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 345 aa  55.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.310162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  37.65 
 
 		 267 aa  54.3  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 304 aa  53.9  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.16 
 
 		 782 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  32.94 
 
 		 272 aa  52.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0967  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.51 
 
 		 890 aa  52  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  28.83 
 
 		 245 aa  52  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.82 
 
 		 938 aa  51.6  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  28.4 
 
 		 283 aa  51.6  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  31.4 
 
 		 269 aa  50.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  25.64 
 
 		 269 aa  50.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  25.64 
 
 		 269 aa  50.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  25.64 
 
 		 269 aa  50.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  26.13 
 
 		 798 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  27.42 
 
 		 304 aa  50.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  28.4 
 
 		 283 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 		 231 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  27.93 
 
 		 258 aa  49.7  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.14 
 
 		 244 aa  49.3  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  32.94 
 
 		 258 aa  49.7  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  28.68 
 
 		 263 aa  48.9  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  33.73 
 
 		 329 aa  48.9  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.82 
 
 		 304 aa  48.5  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  34.57 
 
 		 328 aa  48.5  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 287 aa  48.1  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  24.79 
 
 		 266 aa  47.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  29.41 
 
 		 263 aa  47.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 249 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  25.23 
 
 		 715 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  40.58 
 
 		 228 aa  47.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  26.96 
 
 		 285 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  34.88 
 
 		 258 aa  47  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 312 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  25.64 
 
 		 1090 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 860 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 568 aa  47  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  32.95 
 
 		 345 aa  46.2  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 573 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 468 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.79 
 
 		 573 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  25.49 
 
 		 267 aa  45.8  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  27.5 
 
 		 264 aa  45.8  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2360  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 346 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0361524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  23.95 
 
 		 262 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  23.95 
 
 		 262 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  23.95 
 
 		 262 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  23.95 
 
 		 262 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  36.59 
 
 		 241 aa  45.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  26.28 
 
 		 747 aa  45.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 321 aa  45.1  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.78 
 
 		 689 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>