48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5634 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  51.07 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  39.32 
 
 		 208 aa  162  6e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  41.63 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  43.96 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  37.62 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  36.82 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.5 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  101  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  36.27 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  26.42 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  30.05 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  33.61 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 1023 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  31.67 
 
 		 321 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  31.3 
 
 		 619 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2078  TPR domain-containing protein  23.14 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 257 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 341 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  39.34 
 
 		 334 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 415 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 415 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  29.63 
 
 		 341 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 415 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 486 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 824 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2029  Tetratricopeptide domain protein  29.82 
 
 		 836 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 		 677 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  34.78 
 
 		 415 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 466 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  28.7 
 
 		 339 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 201 aa  42  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 243 aa  42  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  34.15 
 
 		 415 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1406 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 415 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 1737 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>